Ciąg dalszy przygód pomniejszego boga Yato, jego shinki Yukine, który potrafi przybierać formę katany, oraz na pozór zwyczajnej dziewczyny Hiyori. Po raz kolejny mroczna przeszłość głównego bohatera przeszkodzi przyjaciołom w zbieraniu funduszy na świątynię naszego niemal zapomnianego bóstwa i poszukiwaniu sposobu na wyleczenie Hiyori z jej stanu niekontrolowanego opuszczania własnego ciała. Tym razem jednak wydarzenia sprzed kilkuset lat nie tylko wpłyną na obecne problemy naszych bohaterów, ale będą się również łączyć z boginią wojny Bishamon i powodami, dla których darzy ona Yato taką nienawiścią.